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肺癌是目前全球最常見、致死率最高的惡性腫瘤。GLOBALCAN 2022年的數(shù)據(jù),2022年全球肺癌新發(fā)病例數(shù)超過200萬,死亡病例數(shù)超過170萬,是毫無疑問的全球最常見的癌癥,且是患者發(fā)生腫瘤相關(guān)性死亡的主要原因。中國每年新發(fā)肺癌患者占全球1/3,2022年肺癌新發(fā)病例數(shù)約為106.06萬,死亡病例數(shù)約為73.3萬[1]。
隨著對疾病認(rèn)識的不斷加深,腫瘤的治療模式也在發(fā)生變革,個(gè)體化精準(zhǔn)治療模式逐漸成為主流。在NSCLC領(lǐng)域,隨著基因檢測技術(shù)的進(jìn)步和一系列新藥臨床研究的突破,近10年間新發(fā)現(xiàn)的腫瘤驅(qū)動(dòng)基因不斷增多,推動(dòng)了NSCLC靶向治療藥物的研發(fā)和臨床應(yīng)用。
在此背景下,傳統(tǒng)基因檢測方法因基因覆蓋有限,存在漏檢的可能性,以及因組織樣本耗竭而影響后續(xù)檢測等方面的缺陷,已不能充分滿足目前的臨床需求。因此全面的腫瘤相關(guān)基因檢測方法則成為提升NSCLC患者治療效果及預(yù)后的有效手段。中國臨床腫瘤學(xué)會(huì)(CSCO)NSCLC診療指南也提出應(yīng)采用經(jīng)過驗(yàn)證的檢測方法同時(shí)檢測多個(gè)驅(qū)動(dòng)基因。美國國家綜合癌癥網(wǎng)絡(luò)(NCCN)NSCLC指南則強(qiáng)烈支持通過全面分子測序的結(jié)果,指導(dǎo)臨床治療方案的確定。
NCCN和CSCO指南針對NSCLC推薦檢測的biomarker[2,3]
目前常見應(yīng)用于NSCLC中基因變異檢測的技術(shù)包括Sanger測序、熒光原位雜交(fluorescence in situ hybridization,F(xiàn)ISH)、即時(shí)熒光定量聚合酶鏈反應(yīng)(real time?polymerase chain reaction,RT?PCR)、免疫組織化學(xué)(immunohistochemistry,IHC)、二代測序(next generation sequencing)等,如果需進(jìn)行多基因聯(lián)檢一般主要應(yīng)用NGS或者PCR平臺。
非小細(xì)胞肺癌常用分子病理檢測方法主要特點(diǎn)比較[4]
1、PCR的優(yōu)勢
中國抗癌協(xié)會(huì)腫瘤病理專業(yè)委員會(huì)分子病理協(xié)作組聯(lián)合國家藥品監(jiān)督管理局醫(yī)療器械技術(shù)評審中心臨床與生物統(tǒng)計(jì)二部,對我國過去十年肺癌分子檢測臨床應(yīng)用及我國藥監(jiān)部門相關(guān)產(chǎn)品審批情況做了深入研究。根據(jù)對49家大型醫(yī)院的調(diào)研數(shù)據(jù),繪制了2010年至2019年中國大陸地區(qū)非小細(xì)胞肺癌分子病理檢測的整體情況。以非小細(xì)胞肺癌主要驅(qū)動(dòng)基因EGFR、ALK、ROS1的檢測為例,NGS檢測的陽性率略低于PCR檢測的陽性率。
非小細(xì)胞肺癌EGFR、ALK、ROS1陽性率情況[5]
另外一篇《Lung Cancer》上發(fā)表的文章也對PCR試劑及NGS試劑的臨床應(yīng)用性能進(jìn)行了頭對頭的比較,數(shù)據(jù)顯示:PCR試劑在成功率(98.5% vs 87.8%),陽性率(54.9% vs 50.5%)以及檢測周期都優(yōu)于NGS試劑[6]。
2、NGS的優(yōu)勢
一項(xiàng)回顧性研究對比NGS試劑和PCR試劑檢測1312例晚期NSCLC的EGFR變異情況,結(jié)果顯示:PCR試劑在罕見突變方面均存在不足[7]。
NGS與RT-qPCR在EGFR突變檢出情況
在《非小細(xì)胞肺癌表皮生長因子受體20號外顯子插入突變檢測臨床實(shí)踐中國專家共識(2024版)》中提及國外臨床試驗(yàn)和多項(xiàng)真實(shí)世界數(shù)據(jù)分析均提示,僅使用PCR檢測預(yù)計(jì)會(huì)漏檢約50%的EGFR ex20ins陽性NSCLC患者。理論上NGS可檢出目前已報(bào)告的所有ECFR ex20ins 變異形式,因此本共識建議基于NGS的全面測序平臺[8]。
在《非小細(xì)胞肺癌融合基因檢測臨床實(shí)踐中國專家共識(2023版)》雖沒有明確優(yōu)先推薦NGS平臺,但是在檢測流程圖中優(yōu)先考慮NGS平臺,不可及時(shí)再考慮PCR平臺。
晚期初治非小細(xì)胞肺癌融合基因檢測臨床推薦路徑[9]
肺癌基因多聯(lián)檢中的PCR和NGS技術(shù)各有千秋,它們在肺癌的精準(zhǔn)診療中都發(fā)揮著不可或缺的作用。PCR 技術(shù)憑借其高靈敏度、快速檢測和低成本的優(yōu)勢,在已知靶點(diǎn)的快速篩查和治療過程中的動(dòng)態(tài)監(jiān)測方面具有明顯的優(yōu)勢,是肺癌基因檢測領(lǐng)域的“傳統(tǒng)利刃”。而NGS技術(shù)則以其高通量檢測、發(fā)現(xiàn)未知突變和適用于復(fù)雜樣本的特性,為肺癌患者的全面診斷、新藥研發(fā)以及科研探索開啟了一扇新的大門,成為肺癌精準(zhǔn)醫(yī)療發(fā)展的重要推動(dòng)力量。
但從技術(shù)而且并沒有優(yōu)劣之分,只是在不同的應(yīng)用場景會(huì)更加適用,因此需根據(jù)患者的具體情況、醫(yī)療機(jī)構(gòu)的技術(shù)條件以及檢測的目的和需求,合理選擇PCR或NGS技術(shù)進(jìn)行肺癌基因多聯(lián)檢。
飛朔生物致力于為腫瘤個(gè)體化精準(zhǔn)診斷提供整體解決方案,包括早期篩查、疾病診斷、個(gè)體化用藥指導(dǎo)和療效監(jiān)測等領(lǐng)域,根據(jù)肺癌患者不同實(shí)際需求有以下檢測套餐推薦:
[1] CA Cancer J Clin. 2024 May-Jun;74(3):229-263.
[2] CSCO非小細(xì)胞肺癌診療指南(2024版)
[3] NCCN非小細(xì)胞診療指南(2025.v3)
[4] 非小細(xì)胞肺癌分子病理檢測臨床實(shí)踐指南(2024版)
[5] JTO Clin Res Rep. 2021 Mar 11;2(4):100163
[6] Lung Cancer. 2023 May:179:107190.
[7] Lung Cancer. 2024 Dec:198:108002.
[8] 非小細(xì)胞肺癌表皮生長因子受體20號外顯子插入突變檢測臨床實(shí)踐中國專家共識(2024版)
[9] 非小細(xì)胞肺癌融合基因檢測臨床實(shí)踐中國專家共識(2023版)